W ramach pracy badawczej Katedry Topologii i Interdyscyplinarnych Zastosowań Matematyki Uniwersytetu Kazimierza Wielkiego w Bydgoszczy realizowane są następujące zagadnienia:

1. Matematyka stosowana (zastosowania algebry macierzy, metod numerycznych oraz rachunku różniczkowego i całkowego w modelowaniu inżynierskim; zastosowania rachunku prawdopodobieństwa, statystyki matematycznej oraz przekształcenia Fouriera w analizie sygnałów; zastosowania rachunku operatorowego w szeroko rozumianej automatyce).
2. Algorytmiczna teoria liczb.
3. Topologie na zbiorach liczb naturalnych generowane przez ciągi arytmetyczne.

Pracownicy Katedry swoje wyniki publikują w wysoko punktowanych czasopismach z listy filadelfijskiej takich jak Positivity, RACSAM czy Journal of Mathematical Analysis and Applications. Pełnią też funkcję recenzentów w wysoko punktowanych czasopismach o zasięgu międzynarodowym oraz recenzują artykuły dla baz matematycznych Mathematical Reviews i Zentralblatt fur MATH.

W ramach prowadzonej działalności naukowej i dydaktycznej pracownicy Katedry Analizy Matematycznej i Algebry wyspecjalizowali się w zastosowaniach matematyki w technice, ze szczególnym uwzględnieniem kryptologii – usprawnienia szyfrów na alfabetach nieskończonych; automatyki, elektroniki i elektrotechniki – modelowanie światłowodowych sensorów i konwerterów pomiarowych wielkości elektrycznych i nieelektrycznych, analiza sygnałów pomiarowych i telekomunikacyjnych, analiza stanów pracy obiektów automatyki.

W ramach działalności dydaktycznej i współpracy z otoczeniem społeczno-gospodarczym pracownicy Katedry prowadzą zajęcia na kierunku Matematyka oraz na kierunkach technicznych prowadzonych przez inne jednostki Uniwersytetu Kazimierza Wielkiego, takie jak Wydział Mechatroniki, Instytut Informatyki i Instytut Inżynierii Materiałowej.